ವಿನ್ಯಾಸ ಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯ ಪರಿಹಾರ

I. ಸಾರಾಂಶ
ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳು ವಿಶೇಷ ಸ್ಥೂಲ ಅಣುಗಳಾಗಿವೆ, ಅವುಗಳ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಅವುಗಳ ರಾಸಾಯನಿಕ ಮತ್ತು ಭೌತಿಕ ಲಕ್ಷಣಗಳಲ್ಲಿ ಅಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿರುತ್ತವೆ.ಕೆಲವು ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಕಷ್ಟವಾಗಿದ್ದರೆ, ಇತರವುಗಳನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲು ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಸುಲಭ ಆದರೆ ಶುದ್ಧೀಕರಿಸಲು ಕಷ್ಟ.ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಸಮಸ್ಯೆಯೆಂದರೆ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳು ಜಲೀಯ ದ್ರಾವಣಗಳಲ್ಲಿ ಸ್ವಲ್ಪ ಕರಗುತ್ತವೆ, ಆದ್ದರಿಂದ ನಮ್ಮ ಶುದ್ಧೀಕರಣದಲ್ಲಿ, ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ನ ಅನುಗುಣವಾದ ಭಾಗವನ್ನು ಜಲೀಯವಲ್ಲದ ದ್ರಾವಕಗಳಲ್ಲಿ ಕರಗಿಸಬೇಕು, ಆದ್ದರಿಂದ, ಈ ದ್ರಾವಕಗಳು ಅಥವಾ ಬಫರ್‌ಗಳು ಬಳಕೆಗೆ ತೀವ್ರವಾಗಿ ಅಸಮಂಜಸವಾಗಿರುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ. ಜೈವಿಕ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳು, ಆದ್ದರಿಂದ ತಂತ್ರಜ್ಞರು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅನ್ನು ತಮ್ಮ ಸ್ವಂತ ಉದ್ದೇಶಗಳಿಗಾಗಿ ಬಳಸುವುದನ್ನು ಕಟ್ಟುನಿಟ್ಟಾಗಿ ನಿಷೇಧಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ ವಿನ್ಯಾಸದ ಹಲವಾರು ಅಂಶಗಳಾಗಿವೆ.

ವಿನ್ಯಾಸ ಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯ ಪರಿಹಾರ
ಎರಡನೆಯದಾಗಿ, ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ಕಷ್ಟಕರವಾದ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ ಸರಿಯಾದ ಆಯ್ಕೆ
1. ಡೌನ್-ನಿಯಂತ್ರಿತ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಒಟ್ಟು ಉದ್ದ
15 ಕ್ಕಿಂತ ಕಡಿಮೆ ಉಳಿಕೆಗಳ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಪಡೆಯುವುದು ಸುಲಭ ಏಕೆಂದರೆ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ನ ಗಾತ್ರವು ಹೆಚ್ಚಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಕಚ್ಚಾ ಉತ್ಪನ್ನದ ಶುದ್ಧತೆ ಕಡಿಮೆಯಾಗುತ್ತದೆ.ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯ ಒಟ್ಟು ಉದ್ದವು 20 ಶೇಷಗಳನ್ನು ಮೀರಿ ಹೆಚ್ಚಾದಂತೆ, ನಿಖರವಾದ ಉತ್ಪನ್ನದ ಪ್ರಮಾಣವು ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ಕಾಳಜಿಯಾಗಿದೆ.ಅನೇಕ ಪ್ರಯೋಗಗಳಲ್ಲಿ, ಶೇಷ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು 20 ಕ್ಕಿಂತ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಅನಿರೀಕ್ಷಿತ ಪರಿಣಾಮಗಳನ್ನು ಪಡೆಯುವುದು ಸುಲಭ.
2. ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಅವಶೇಷಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿ
ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಅವಶೇಷಗಳ ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಾಬಲ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳು, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಸ್‌ನಿಂದ 7-12 ಶೇಷಗಳ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ತೊಂದರೆಗಳನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುತ್ತವೆ.ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಬಿ-ಫೋಲ್ಡ್ ಶೀಟ್ ಅನ್ನು ಪಡೆಯುವುದರಿಂದ ಇದು ಅಸಮರ್ಪಕ ಸಂಯೋಜನೆಯಾಗಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ."ಅಂತಹ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ, ಎರಡು ಧನಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಋಣಾತ್ಮಕ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಪರಿವರ್ತಿಸಲು ಅಥವಾ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ಅನ್ಲಾಕ್ ಮಾಡಲು ಗ್ಲೈ ಅಥವಾ ಪ್ರೊ ಅನ್ನು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗೆ ಹಾಕಲು ಇದು ಉಪಯುಕ್ತವಾಗಬಹುದು."
3. "ಕಷ್ಟ" ಉಳಿಕೆಗಳ ಡೌನ್‌ರೆಗ್ಯುಲೇಷನ್
"ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸುಲಭವಾಗಿ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸದ ಹಲವಾರು Cys, Met, Arg ಮತ್ತು ಟ್ರೈ ಅವಶೇಷಗಳಿವೆ."ಸೆರ್ ಅನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ Cys ಗೆ ನಾನ್ ಆಕ್ಸಿಡೇಟಿವ್ ಪರ್ಯಾಯವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ವಿನ್ಯಾಸ ಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯ ಪರಿಹಾರ

ಮೂರನೆಯದಾಗಿ, ನೀರಿನಲ್ಲಿ ಕರಗುವ ಸರಿಯಾದ ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ಸುಧಾರಿಸಿ
1. N ಅಥವಾ C ಟರ್ಮಿನಸ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿಸಿ
ಆಮ್ಲೀಯ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ (ಅಂದರೆ, pH 7 ನಲ್ಲಿ ಋಣಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಚಾರ್ಜ್ ಆಗುತ್ತದೆ), ಅಸಿಟೈಲೇಷನ್ (N-ಟರ್ಮಿನಸ್ ಅಸಿಟೈಲೇಷನ್, C ಟರ್ಮಿನಸ್ ಯಾವಾಗಲೂ ಉಚಿತ ಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲ್ ಗುಂಪನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ) ಋಣಾತ್ಮಕ ಚಾರ್ಜ್ ಅನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿದೆ.ಆದಾಗ್ಯೂ, ಮೂಲಭೂತ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳಿಗೆ (ಅಂದರೆ, pH 7 ನಲ್ಲಿ ಧನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಚಾರ್ಜ್ ಆಗುತ್ತದೆ), ಅಮಿನೇಷನ್ (N-ಟರ್ಮಿನಸ್‌ನಲ್ಲಿ ಉಚಿತ ಅಮೈನೋ ಗುಂಪು ಮತ್ತು C-ಟರ್ಮಿನಸ್‌ನಲ್ಲಿ ಅಮೀನೇಶನ್) ಧನಾತ್ಮಕ ಚಾರ್ಜ್ ಅನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿದೆ.

2. ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಬಹಳವಾಗಿ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿ ಅಥವಾ ಉದ್ದಗೊಳಿಸಿ

ಕೆಲವು ಅನುಕ್ರಮಗಳು Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr ಮತ್ತು Ala ಮುಂತಾದ ದೊಡ್ಡ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ.ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ನ ಧನಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಋಣಾತ್ಮಕ ಧ್ರುವಗಳನ್ನು ಮತ್ತಷ್ಟು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸಲು ಇದು ಉಪಯುಕ್ತವಾಗಬಹುದು.ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಧನಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಋಣಾತ್ಮಕ ಧ್ರುವಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯ ಗಾತ್ರವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವುದು ಎರಡನೆಯ ಆಯ್ಕೆಯಾಗಿದೆ.ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯ ಧನಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಋಣಾತ್ಮಕ ಬದಿಗಳು ಬಲವಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಅದು ನೀರಿನಿಂದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸುವ ಸಾಧ್ಯತೆ ಹೆಚ್ಚು.
3. ನೀರಿನಲ್ಲಿ ಕರಗುವ ಶೇಷದಲ್ಲಿ ಹಾಕಿ
ಕೆಲವು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಗಳಿಗೆ, ಕೆಲವು ಧನಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಋಣಾತ್ಮಕ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಯು ನೀರಿನ ಕರಗುವಿಕೆಯನ್ನು ಸುಧಾರಿಸುತ್ತದೆ.ಗ್ಲು-ಗ್ಲು ಜೊತೆಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸಲು ಆಮ್ಲೀಯ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಸ್ ಅಥವಾ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಸ್ ಅನ್ನು ನಮ್ಮ ಕಂಪನಿ ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುತ್ತದೆ.ಮೂಲ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ನ N ಅಥವಾ C ಟರ್ಮಿನಸ್ ಅನ್ನು ನೀಡಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ನಂತರ Lys-Lys.ಚಾರ್ಜ್ ಮಾಡಲಾದ ಗುಂಪನ್ನು ಇರಿಸಲಾಗದಿದ್ದರೆ, Ser-Gly-Ser ಅನ್ನು N ಅಥವಾ C ಟರ್ಮಿನಸ್‌ನಲ್ಲಿ ಇರಿಸಬಹುದು.ಆದಾಗ್ಯೂ, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯ ಬದಿಗಳನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಲಾಗದಿದ್ದಾಗ ಈ ವಿಧಾನವು ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವುದಿಲ್ಲ.