ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಕಸ್ಟಮ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧ ರಚನೆಯ ತತ್ವ ಹೇಗೆ?

ಮೇಲ್ಮೈಯಲ್ಲಿ, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳ ರಚನೆಯು ಡೈಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಸರಳವಾದ ರಾಸಾಯನಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿದೆ.ಇದರರ್ಥ ಎರಡು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಘಟಕಗಳು ನಿರ್ಜಲೀಕರಣಗೊಂಡಾಗ ಅಮೈಡ್ ಬಂಧದ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧದಿಂದ ಸಂಪರ್ಕ ಹೊಂದಿವೆ.

ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧ ರಚನೆಯು ಸೌಮ್ಯವಾದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯಾಗಿದೆ.(A) ಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲ್ ಭಾಗ, ಎರಡನೇ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ (B) ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಫಿಲಿಕ್ ಸಕ್ರಿಯ ಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲ್ ಭಾಗವು ನಂತರ ಡೈಪೆಪ್ಟೈಡ್ (AB) ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ."ಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲ್ ಘಟಕವನ್ನು (ಎ) ರಕ್ಷಿಸದಿದ್ದರೆ, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧದ ರಚನೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ."ರೇಖೀಯ ಮತ್ತು ಆವರ್ತಕ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳಂತಹ ಉಪ-ಉತ್ಪನ್ನಗಳನ್ನು ಗುರಿ ಸಂಯುಕ್ತಗಳಾದ AB ನೊಂದಿಗೆ ಬೆರೆಸಬಹುದು.ಆದ್ದರಿಂದ, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಭಾಗಿಯಾಗದ ಎಲ್ಲಾ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ತಾತ್ಕಾಲಿಕವಾಗಿ ಹಿಂತಿರುಗಿಸಬಹುದಾದ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ರಕ್ಷಿಸಬೇಕು.

ಆದ್ದರಿಂದ, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ - ಪ್ರತಿ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧದ ರಚನೆಯು - ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವಿಕೆಯ ಮೂರು ಹಂತಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ.

ರಕ್ಷಣೆಯ ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಕೆಲವು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ತಯಾರಿಸುವುದು ಮೊದಲ ಹಂತವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಝವಿಟೆರಿಯಾನಿಕ್ ರಚನೆಯು ಇನ್ನು ಮುಂದೆ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿಲ್ಲ.

ಎರಡನೇ ಹಂತವು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಎರಡು-ಹಂತದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ N- ರಕ್ಷಿತ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲ್ ಗುಂಪನ್ನು ಮೊದಲು ಸಕ್ರಿಯ ಮಧ್ಯಂತರಕ್ಕೆ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಂತರ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧವು ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ.ಈ ಸಂಯೋಜಿತ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯು ಒಂದು-ಹಂತದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿ ಅಥವಾ ಎರಡು ಅನುಕ್ರಮ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳಾಗಿ ಸಂಭವಿಸಬಹುದು.

ಮೂರನೇ ಹಂತವು ಆಯ್ದ ತೆಗೆಯುವಿಕೆ ಅಥವಾ ರಕ್ಷಣಾತ್ಮಕ ನೆಲೆಯನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ತೆಗೆದುಹಾಕುವುದು.ಎಲ್ಲಾ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಗಳನ್ನು ಜೋಡಿಸಿದ ನಂತರ ಮಾತ್ರ ಎಲ್ಲಾ ತೆಗೆಯುವಿಕೆ ಸಂಭವಿಸಬಹುದು, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಮುಂದುವರಿಸಲು ರಕ್ಷಣಾತ್ಮಕ ಗುಂಪುಗಳ ಆಯ್ದ ತೆಗೆಯುವಿಕೆ ಸಹ ಅಗತ್ಯವಿದೆ.

ಏಕೆಂದರೆ 10 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec ಮತ್ತು Cys) ಸೈಡ್ ಚೈನ್ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಇದು ಆಯ್ದ ರಕ್ಷಣೆಯ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ಸಂಕೀರ್ಣಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.ಆಯ್ಕೆಗಾಗಿ ವಿಭಿನ್ನ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳ ಕಾರಣ ತಾತ್ಕಾಲಿಕ ಮತ್ತು ಅರೆ-ಶಾಶ್ವತ ರಕ್ಷಣೆಯ ನೆಲೆಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಬೇಕು.ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಅಥವಾ ಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲ್ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಗುಂಪುಗಳ ತಾತ್ಕಾಲಿಕ ರಕ್ಷಣೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿಬಿಂಬಿಸಲು ಮುಂದಿನ ಹಂತದಲ್ಲಿ ತಾತ್ಕಾಲಿಕ ರಕ್ಷಣೆ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.ಅರೆ-ಶಾಶ್ವತ ರಕ್ಷಣಾತ್ಮಕ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಈಗಾಗಲೇ ರೂಪುಗೊಂಡ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳು ಅಥವಾ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅಡ್ಡ ಸರಪಳಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಮಧ್ಯಪ್ರವೇಶಿಸದೆ ತೆಗೆದುಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ, ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ.

"ತಾತ್ತ್ವಿಕವಾಗಿ, ಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲ್ ಘಟಕದ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳ (ಕಪ್ಲಿಂಗ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳು) ನಂತರದ ರಚನೆಯು ರೇಸ್ಮಿಕ್ ಅಥವಾ ಉಪ-ಉತ್ಪನ್ನ ರಚನೆಯಿಲ್ಲದೆ ತ್ವರಿತವಾಗಿರಬೇಕು ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ ಇಳುವರಿಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಲು ಮೋಲಾರ್ ರಿಯಾಕ್ಟಂಟ್ಗಳನ್ನು ಅನ್ವಯಿಸಬೇಕು."ದುರದೃಷ್ಟವಶಾತ್, ಯಾವುದೇ ರಾಸಾಯನಿಕ ಜೋಡಣೆ ವಿಧಾನಗಳು ಈ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳನ್ನು ಪೂರೈಸುವುದಿಲ್ಲ, ಮತ್ತು ಕೆಲವು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಸೂಕ್ತವಾಗಿವೆ.

ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ವಿವಿಧ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಗುಂಪುಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಹಸ್ತಚಾಲಿತ ಕೇಂದ್ರಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿವೆ, ಗ್ಲೈಸಿನ್ ಮಾತ್ರ ಅಪವಾದವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ತಿರುಗುವಿಕೆಯ ಸಂಭವನೀಯ ಅಪಾಯವಿದೆ.

ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಚಕ್ರದ ಅಂತಿಮ ಹಂತವು ಎಲ್ಲಾ ರಕ್ಷಣಾತ್ಮಕ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುವುದು.ಡಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ರಕ್ಷಣೆಯನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ತೆಗೆದುಹಾಕುವ ಅವಶ್ಯಕತೆಯ ಜೊತೆಗೆ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಚೈನ್ ವಿಸ್ತರಣೆಗೆ ರಕ್ಷಣಾತ್ಮಕ ಗುಂಪುಗಳ ಆಯ್ದ ತೆಗೆಯುವಿಕೆ ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ.ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಎಚ್ಚರಿಕೆಯಿಂದ ಯೋಜಿಸಬೇಕು.ಕಾರ್ಯತಂತ್ರದ ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿ, N α-ಅಮಿನೋ ಅಥವಾ ಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲ್ ರಕ್ಷಿಸುವ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಆಯ್ದವಾಗಿ ತೆಗೆದುಹಾಕಬಹುದು."ತಂತ್ರ" ಎಂಬ ಪದವು ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಘನೀಕರಣ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ, ಕ್ರಮೇಣ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ತುಣುಕು ಘನೀಕರಣದ ನಡುವೆ ವ್ಯತ್ಯಾಸವಿದೆ.ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ (ಇದನ್ನು "ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ" ಎಂದೂ ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ) ದ್ರಾವಣದಲ್ಲಿ ನಡೆಯುತ್ತದೆ.ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯ ಕ್ರಮೇಣ ಉದ್ದವನ್ನು ಸಣ್ಣ ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯನ್ನು ಬಳಸುವ ಮೂಲಕ ಮಾತ್ರ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಬಹುದು.ಉದ್ದವಾದ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲು, ಗುರಿಯ ಅಣುಗಳನ್ನು ಸೂಕ್ತ ತುಣುಕುಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಬೇಕು ಮತ್ತು ಅವು C ಟರ್ಮಿನಸ್‌ನಲ್ಲಿ ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಬಹುದು ಎಂದು ನಿರ್ಧರಿಸಬೇಕು.ಪ್ರತ್ಯೇಕ ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ಕ್ರಮೇಣವಾಗಿ ಜೋಡಿಸಿದ ನಂತರ, ಗುರಿ ಸಂಯುಕ್ತವನ್ನು ಜೋಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ತಂತ್ರವು ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಮತ್ತು ಅತ್ಯಂತ ಸೂಕ್ತವಾದ ರಕ್ಷಣಾತ್ಮಕ ತುಣುಕಿನ ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಮತ್ತು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ತಂತ್ರವು ರಕ್ಷಣಾತ್ಮಕ ನೆಲೆಗಳ ಅತ್ಯಂತ ಸೂಕ್ತವಾದ ಸಂಯೋಜನೆಯ ಆಯ್ಕೆ ಮತ್ತು ತುಣುಕು ಸಂಯೋಗದ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ವಿಧಾನವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.