ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳ ರಚನಾತ್ಮಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಮತ್ತು ವರ್ಗೀಕರಣ

ಅನೇಕ ರೀತಿಯ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳಿವೆ, ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ವರ್ಗೀಕರಣವು ಭೌತಿಕ ಮತ್ತು ರಾಸಾಯನಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು, ಮೂಲಗಳು, ಸೇವನೆಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳು ಮತ್ತು ಬಯೋಮೆಡಿಕಲ್ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್‌ಗಳನ್ನು ಆಧರಿಸಿದೆ.ಅವುಗಳ ಭೌತಿಕ ಮತ್ತು ರಾಸಾಯನಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಪ್ರಕಾರ, ಮೆಂಬರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಮೂರು ವಿಧಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಬಹುದು: ಕ್ಯಾಟಯಾನಿಕ್, ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ಮತ್ತು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್.ಕ್ಯಾಟಯಾನಿಕ್ ಮತ್ತು ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ಮೆಂಬರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳು 85% ರಷ್ಟಿದ್ದರೆ, ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಮೆಂಬರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳು ಕೇವಲ 15% ರಷ್ಟಿದೆ.

1. ಕ್ಯಾಟಯಾನಿಕ್ ಮೆಂಬರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ನುಗ್ಗುವಿಕೆ

ಕ್ಯಾಟಯಾನಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳು ಟಿಎಟಿ, ಪೆನೆಟ್ರಾಟಿನ್, ಪಾಲಿಯರ್ಜಿನೈನ್, ಪಿ 22 ಎನ್, ಡಿಪಿವಿ 3 ಮತ್ತು ಡಿಪಿವಿ 6 ನಂತಹ ಅರ್ಜಿನೈನ್, ಲೈಸೈನ್ ಮತ್ತು ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಸಮೃದ್ಧವಾಗಿರುವ ಸಣ್ಣ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದೆ.ಅವುಗಳಲ್ಲಿ, ಅರ್ಜಿನೈನ್ ಗ್ವಾನಿಡಿನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ, ಇದು ಜೀವಕೋಶ ಪೊರೆಯ ಮೇಲೆ ಋಣಾತ್ಮಕ ಆವೇಶದ ಫಾಸ್ಪರಿಕ್ ಆಸಿಡ್ ಗುಂಪುಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಶಾರೀರಿಕ PH ಮೌಲ್ಯದ ಸ್ಥಿತಿಯ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಪೊರೆಯೊಳಗೆ ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ.ಒಲಿಗಾರ್ಜಿನೈನ್ (3 R ನಿಂದ 12 R ವರೆಗೆ) ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಅರ್ಜಿನೈನ್ ಪ್ರಮಾಣವು 8 ಕ್ಕಿಂತ ಕಡಿಮೆಯಾದಾಗ ಮಾತ್ರ ಪೊರೆಯ ಒಳಹೊಕ್ಕು ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಸಾಧಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅರ್ಜಿನೈನ್ ಪ್ರಮಾಣವು ಹೆಚ್ಚಾಗುವುದರೊಂದಿಗೆ ಪೊರೆಯ ನುಗ್ಗುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವು ಕ್ರಮೇಣ ಹೆಚ್ಚಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ.ಲೈಸಿನ್, ಅರ್ಜಿನೈನ್ ನಂತಹ ಕ್ಯಾಟಯಾನಿಕ್ ಆದರೂ, ಗ್ವಾನಿಡಿನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ, ಆದ್ದರಿಂದ ಅದು ಏಕಾಂಗಿಯಾಗಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದ್ದಾಗ, ಅದರ ಪೊರೆಯ ಒಳಹೊಕ್ಕು ದಕ್ಷತೆಯು ತುಂಬಾ ಹೆಚ್ಚಿರುವುದಿಲ್ಲ.ಫುಟಾಕಿ ಮತ್ತು ಇತರರು.(2001) ಕ್ಯಾಟಯಾನಿಕ್ ಸೆಲ್ ಮೆಂಬರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಕನಿಷ್ಠ 8 ಧನಾತ್ಮಕ ಆವೇಶದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವಾಗ ಮಾತ್ರ ಉತ್ತಮ ಪೊರೆಯ ನುಗ್ಗುವ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಸಾಧಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದೆ.ಪೊರೆಯೊಳಗೆ ನುಗ್ಗುವ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳಿಗೆ ಧನಾತ್ಮಕ ಆವೇಶದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅವಶೇಷಗಳು ಅತ್ಯಗತ್ಯವಾದರೂ, ಇತರ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಅಷ್ಟೇ ಮುಖ್ಯ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ W14 ಎಫ್ ಆಗಿ ರೂಪಾಂತರಗೊಂಡಾಗ, ಪೆನೆಟ್ರಾಟಿನ್‌ನ ನುಗ್ಗುವಿಕೆ ಕಳೆದುಹೋಗುತ್ತದೆ.

ಕ್ಯಾಟಯಾನಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ ವಿಶೇಷ ವರ್ಗವೆಂದರೆ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ಲೋಕಲೈಸೇಶನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ (NLSs), ಇದು ಅರ್ಜಿನೈನ್, ಲೈಸಿನ್ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಲಿನ್‌ನಲ್ಲಿ ಸಮೃದ್ಧವಾಗಿರುವ ಸಣ್ಣ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್‌ಗೆ ಪರಮಾಣು ರಂಧ್ರ ಸಂಕೀರ್ಣದ ಮೂಲಕ ಸಾಗಿಸಬಹುದು.NLS ಗಳನ್ನು ಏಕ ಮತ್ತು ಡಬಲ್ ಟೈಪಿಂಗ್ ಎಂದು ವಿಂಗಡಿಸಬಹುದು, ಕ್ರಮವಾಗಿ ಮೂಲಭೂತ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಒಂದು ಮತ್ತು ಎರಡು ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ.ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಸಿಮಿಯನ್ ವೈರಸ್ 40(SV40) ನಿಂದ PKKKRKV ಒಂದೇ ಟೈಪಿಂಗ್ NLS ಆಗಿದ್ದರೆ, ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡಬಲ್ ಟೈಪಿಂಗ್ NLS ಆಗಿದೆ.KRPAATKKAGQAKKKL ಎಂಬುದು ಪೊರೆಯ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್‌ನಲ್ಲಿ ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುವ ಕಿರು ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿದೆ.ಹೆಚ್ಚಿನ NLS ಗಳು 8 ಕ್ಕಿಂತ ಕಡಿಮೆ ಚಾರ್ಜ್ ಸಂಖ್ಯೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದರಿಂದ, NLS ಗಳು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳಲ್ಲ, ಆದರೆ ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಗೆ ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಲಿಂಕ್ ಮಾಡಿದಾಗ ಅವು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳಾಗಿರಬಹುದು.

ರಚನಾತ್ಮಕ-2

2. ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್

ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳು ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಕ್ ಮತ್ತು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಡೊಮೇನ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ, ಇವುಗಳನ್ನು ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್, ಸೆಕೆಂಡರಿ α-ಹೆಲಿಕಲ್ ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್, β-ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಲಿನ್-ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ಎಂದು ವಿಂಗಡಿಸಬಹುದು.

ಪ್ರಾಥಮಿಕ ವಿಧದ ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ವೇರ್ ಮೆಂಬರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಎರಡು ವರ್ಗಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲಾಗಿದೆ, MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) ಮತ್ತು Pep - 1 (KETWWETWTWTEWKVKVKV) ಯಂತಹ Pep - 1 (KETWWETWTWTEWKVKVKV) ಯ ಸ್ಥಳೀಯ ಸಂಕೇತಗಳನ್ನು ಆಧರಿಸಿದ Pep - 1 (KETWWETWKREWKVKVK) ಎರಡೂ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ ಕೋವೆಲೆಂಟ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕಗೊಂಡಿರುವ NLSಗಳೊಂದಿಗೆ ವರ್ಗ ಇದರಲ್ಲಿ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ MPG ಯ ಡೊಮೇನ್ HIV ಗ್ಲೈಕೊಪ್ರೋಟೀನ್ 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A) ನ ಸಮ್ಮಿಳನ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ, ಮತ್ತು ಪೆಪ್-1 ನ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಡೊಮೇನ್ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮೆಂಬರೇನ್ ಅಫಿನಿಟಿ (KETWWET WWTEW) ಹೊಂದಿರುವ ಟ್ರಿಪ್ಟೊಫಾನ್ ಸಮೃದ್ಧ ಕ್ಲಸ್ಟರ್‌ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ.ಆದಾಗ್ಯೂ, ಎರಡರ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಡೊಮೇನ್‌ಗಳು WSQP ಮೂಲಕ ಪರಮಾಣು ಸ್ಥಳೀಕರಣ ಸಂಕೇತ PKKKRKV ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕ ಹೊಂದಿವೆ.ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ ಮತ್ತೊಂದು ವರ್ಗವು ನೈಸರ್ಗಿಕ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ pVEC, ARF(1-22) ಮತ್ತು BPrPr(1-28).

ದ್ವಿತೀಯ α-ಹೆಲಿಕಲ್ ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳು α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಮೂಲಕ ಪೊರೆಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಕ್ ಮತ್ತು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅವಶೇಷಗಳು ಹೆಲಿಕಲ್ ರಚನೆಯ ವಿವಿಧ ಮೇಲ್ಮೈಗಳಲ್ಲಿ ನೆಲೆಗೊಂಡಿವೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).ಬೀಟಾ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಟೈಪ್ ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ವೇರ್ ಮೆಂಬರೇನ್‌ಗೆ, ಬೀಟಾ ಪ್ಲೆಟೆಡ್ ಶೀಟ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುವ ಅದರ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವು ಪೊರೆಯ ಒಳಹೊಕ್ಕು ಸಾಮರ್ಥ್ಯಕ್ಕೆ ನಿರ್ಣಾಯಕವಾಗಿದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) ಯಲ್ಲಿ ಮೆಂಬರೇನ್ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಸಂಶೋಧನೆ ಮಾಡುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ, - ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ರೂಪಾಂತರದ ಸಾದೃಶ್ಯಗಳು ಬೀಟಾ ಮಡಿಸಿದ ತುಂಡನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗಲಿಲ್ಲ, ಪೊರೆಯ ಒಳಹೊಕ್ಕು ಸಾಮರ್ಥ್ಯವು ತುಂಬಾ ಕಳಪೆಯಾಗಿದೆ.ಪ್ರೋಲಿನ್-ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳಲ್ಲಿ, ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಲಿನ್ ಹೆಚ್ಚು ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದಾಗ ಪಾಲಿಪ್ರೊಲಿನ್ II ​​(PPII) ಶುದ್ಧ ನೀರಿನಲ್ಲಿ ಸುಲಭವಾಗಿ ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ.PPII ಪ್ರತಿ ತಿರುವಿನಲ್ಲಿ 3.0 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಉಳಿಕೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಎಡಗೈ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಆಗಿದೆ, ಪ್ರತಿ ತಿರುವಿನಲ್ಲಿ 3.6 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಉಳಿಕೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರಮಾಣಿತ ಬಲಗೈ ಆಲ್ಫಾ-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ರಚನೆಗೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ.ಪ್ರೋಲೈನ್-ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ ಆಂಫಿಫಿಲಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳು ಬೋವಿನ್ ಆಂಟಿಮೈಕ್ರೊಬಿಯಲ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ 7(Bac7), ಸಿಂಥೆಟಿಕ್ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ (PPR)n(n 3, 4, 5 ಮತ್ತು 6 ಆಗಿರಬಹುದು), ಇತ್ಯಾದಿ.

ರಚನಾತ್ಮಕ-3

3. ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಮೆಂಬರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ನುಗ್ಗುವಿಕೆ

ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳು ಧ್ರುವೀಯವಲ್ಲದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಉಳಿಕೆಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ, ಅಮೈನೋ ಆಸಿಡ್ ಅನುಕ್ರಮದ ಒಟ್ಟು ಚಾರ್ಜ್‌ನ 20% ಕ್ಕಿಂತ ಕಡಿಮೆ ನಿವ್ವಳ ಚಾರ್ಜ್ ಅಥವಾ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್‌ಗೆ ಅಗತ್ಯವಾದ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಭಾಗಗಳು ಅಥವಾ ರಾಸಾಯನಿಕ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ.ಈ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಕಡೆಗಣಿಸಲಾಗಿದ್ದರೂ, ಕಪೋಸಿಯ ಸಾರ್ಕೋಮಾದಿಂದ ಫೈಬ್ರೊಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಅಂಶ (K-FGF) ಮತ್ತು ಫೈಬ್ರೊಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಅಂಶ 12 (F-GF12) ನಂತಹ ಅವು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿವೆ.


ಪೋಸ್ಟ್ ಸಮಯ: ಮಾರ್ಚ್-19-2023